Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms