Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nop58Q6DFW4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms