Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6DFW0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6DFW0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6DFW0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6DFW0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms