Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
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Pdzrn3Q69ZS0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Pdzrn3Q69ZS0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzrn3Q69ZS0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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