Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp4eQ66X19 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms