Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VclQ64727 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VclQ64727 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VclQ64727 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VclQ64727 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VclQ64727 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VclQ64727 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VclQ64727 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VclQ64727 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VclQ64727 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VclQ64727 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VclQ64727 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VclQ64727 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VclQ64727 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VclQ64727 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VclQ64727 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VclQ64727 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VclQ64727 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VclQ64727 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VclQ64727 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VclQ64727 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VclQ64727 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VclQ64727 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VclQ64727 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VclQ64727 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VclQ64727 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VclQ64727 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VclQ64727 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VclQ64727 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VclQ64727 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VclQ64727 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VclQ64727 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VclQ64727 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VclQ64727 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VclQ64727 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VclQ64727 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VclQ64727 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VclQ64727 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VclQ64727 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VclQ64727 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VclQ64727 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VclQ64727 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VclQ64727 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VclQ64727 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VclQ64727 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VclQ64727 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VclQ64727 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VclQ64727 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VclQ64727 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VclQ64727 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VclQ64727 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VclQ64727 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VclQ64727 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VclQ64727 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VclQ64727 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VclQ64727 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VclQ64727 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VclQ64727 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VclQ64727 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VclQ64727 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VclQ64727 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
VclQ64727 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VclQ64727 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VclQ64727 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms