Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ca4Q64444 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ca4Q64444 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ca4Q64444 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ca4Q64444 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ca4Q64444 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ca4Q64444 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ca4Q64444 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ca4Q64444 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ca4Q64444 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ca4Q64444 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ca4Q64444 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ca4Q64444 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ca4Q64444 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ca4Q64444 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ca4Q64444 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ca4Q64444 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ca4Q64444 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ca4Q64444 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ca4Q64444 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ca4Q64444 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ca4Q64444 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ca4Q64444 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ca4Q64444 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ca4Q64444 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ca4Q64444 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ca4Q64444 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ca4Q64444 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ca4Q64444 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ca4Q64444 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ca4Q64444 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ca4Q64444 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ca4Q64444 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ca4Q64444 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ca4Q64444 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ca4Q64444 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ca4Q64444 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ca4Q64444 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ca4Q64444 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ca4Q64444 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ca4Q64444 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ca4Q64444 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ca4Q64444 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ca4Q64444 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ca4Q64444 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ca4Q64444 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ca4Q64444 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ca4Q64444 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ca4Q64444 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ca4Q64444 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ca4Q64444 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ca4Q64444 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ca4Q64444 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ca4Q64444 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ca4Q64444 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ca4Q64444 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ca4Q64444 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ca4Q64444 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ca4Q64444 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ca4Q64444 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms