Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa17Q64016 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa17Q64016 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Defa17Q64016 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Defa17Q64016 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa17Q64016 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa17Q64016 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa17Q64016 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Defa17Q64016 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa17Q64016 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Defa17Q64016 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa17Q64016 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Defa17Q64016 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Defa17Q64016 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa17Q64016 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Defa17Q64016 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa17Q64016 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Defa17Q64016 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa17Q64016 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Defa17Q64016 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa17Q64016 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Defa17Q64016 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
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Defa17Q64016 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa17Q64016 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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Defa17Q64016 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Defa17Q64016 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Defa17Q64016 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa17Q64016 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa17Q64016 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Defa17Q64016 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Defa17Q64016 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Defa17Q64016 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa17Q64016 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa17Q64016 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Defa17Q64016 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa17Q64016 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa17Q64016 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Defa17Q64016 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa17Q64016 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Defa17Q64016 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa17Q64016 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa17Q64016 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Defa17Q64016 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa17Q64016 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Defa17Q64016 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Defa17Q64016 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa17Q64016 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa17Q64016 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa17Q64016 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa17Q64016 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa17Q64016 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa17Q64016 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa17Q64016 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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