Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms