Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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