Protein–RNA interactions for Protein: Q62270

Srms, Tyrosine-protein kinase Srms, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmsQ62270 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrmsQ62270 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms