Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms