Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Sema3bQ62177 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Sema3bQ62177 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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