Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms