Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prkd1Q62101 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prkd1Q62101 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prkd1Q62101 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prkd1Q62101 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prkd1Q62101 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prkd1Q62101 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prkd1Q62101 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prkd1Q62101 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prkd1Q62101 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prkd1Q62101 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prkd1Q62101 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prkd1Q62101 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prkd1Q62101 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prkd1Q62101 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prkd1Q62101 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms