Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkciQ62074 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkciQ62074 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkciQ62074 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkciQ62074 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkciQ62074 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkciQ62074 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkciQ62074 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkciQ62074 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkciQ62074 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms