Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Lama3Q61789 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama3Q61789 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama3Q61789 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama3Q61789 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama3Q61789 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama3Q61789 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama3Q61789 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama3Q61789 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama3Q61789 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama3Q61789 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama3Q61789 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Lama3Q61789 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Lama3Q61789 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama3Q61789 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama3Q61789 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Lama3Q61789 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Lama3Q61789 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Lama3Q61789 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Lama3Q61789 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Lama3Q61789 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Lama3Q61789 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Lama3Q61789 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Lama3Q61789 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Lama3Q61789 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Lama3Q61789 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Lama3Q61789 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama3Q61789 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms