Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msi1Q61474 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms