Protein–RNA interactions for Protein: Q61458

Ccnh, Cyclin-H, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnhQ61458 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CcnhQ61458 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnhQ61458 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms