Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PcolceQ61398 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms