Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcd2Q61285 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms