Protein–RNA interactions for Protein: Q61233

Lcp1, Plastin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcp1Q61233 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lcp1Q61233 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms