Protein–RNA interactions for Protein: Q61221

Hif1a, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif1aQ61221 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hif1aQ61221 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms