Protein–RNA interactions for Protein: Q61147

Cp, Ceruloplasmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpQ61147 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CpQ61147 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CpQ61147 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CpQ61147 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CpQ61147 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CpQ61147 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CpQ61147 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CpQ61147 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CpQ61147 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CpQ61147 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CpQ61147 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CpQ61147 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CpQ61147 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CpQ61147 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CpQ61147 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CpQ61147 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CpQ61147 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CpQ61147 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CpQ61147 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CpQ61147 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CpQ61147 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CpQ61147 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CpQ61147 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CpQ61147 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CpQ61147 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CpQ61147 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CpQ61147 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CpQ61147 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CpQ61147 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CpQ61147 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CpQ61147 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CpQ61147 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CpQ61147 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CpQ61147 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CpQ61147 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CpQ61147 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CpQ61147 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CpQ61147 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CpQ61147 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CpQ61147 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CpQ61147 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CpQ61147 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CpQ61147 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CpQ61147 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CpQ61147 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CpQ61147 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CpQ61147 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CpQ61147 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CpQ61147 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CpQ61147 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CpQ61147 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CpQ61147 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CpQ61147 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CpQ61147 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CpQ61147 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CpQ61147 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CpQ61147 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CpQ61147 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CpQ61147 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CpQ61147 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CpQ61147 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CpQ61147 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CpQ61147 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CpQ61147 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CpQ61147 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CpQ61147 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CpQ61147 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CpQ61147 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CpQ61147 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CpQ61147 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CpQ61147 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CpQ61147 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CpQ61147 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CpQ61147 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CpQ61147 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CpQ61147 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CpQ61147 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CpQ61147 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CpQ61147 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CpQ61147 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CpQ61147 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CpQ61147 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CpQ61147 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CpQ61147 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CpQ61147 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CpQ61147 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CpQ61147 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CpQ61147 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CpQ61147 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CpQ61147 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CpQ61147 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CpQ61147 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CpQ61147 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CpQ61147 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CpQ61147 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CpQ61147 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CpQ61147 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CpQ61147 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CpQ61147 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CpQ61147 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms