Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp4Q61107 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp4Q61107 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp4Q61107 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms