Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms