Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms