Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms