Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkiQ60698 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SkiQ60698 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SkiQ60698 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SkiQ60698 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SkiQ60698 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms