Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms