Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc42Q5SV66 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc42Q5SV66 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms