Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Znrf3Q5SSZ7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znrf3Q5SSZ7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znrf3Q5SSZ7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znrf3Q5SSZ7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znrf3Q5SSZ7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znrf3Q5SSZ7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znrf3Q5SSZ7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znrf3Q5SSZ7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znrf3Q5SSZ7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znrf3Q5SSZ7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znrf3Q5SSZ7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znrf3Q5SSZ7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znrf3Q5SSZ7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znrf3Q5SSZ7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znrf3Q5SSZ7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znrf3Q5SSZ7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znrf3Q5SSZ7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znrf3Q5SSZ7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms