Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme4Q5SSW2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms