Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sft2d1Q5SSN7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms