Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp18Q5SSI6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms