Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Gm11487Q5RIS0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11487Q5RIS0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms