Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Trappc1Q5NCF2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Trappc1Q5NCF2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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