Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms