Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
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