Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms