Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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