Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc8bQ5DU41 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms