Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf2Q59J78 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms