Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rhox3aQ4TU90 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhox3aQ4TU90 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms