Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms