Protein–RNA interactions for Protein: Q497V5

Srbd1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srbd1Q497V5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Srbd1Q497V5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Srbd1Q497V5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Srbd1Q497V5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Srbd1Q497V5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Srbd1Q497V5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srbd1Q497V5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srbd1Q497V5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srbd1Q497V5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srbd1Q497V5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srbd1Q497V5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srbd1Q497V5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srbd1Q497V5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srbd1Q497V5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srbd1Q497V5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srbd1Q497V5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Srbd1Q497V5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srbd1Q497V5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srbd1Q497V5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Srbd1Q497V5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srbd1Q497V5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Srbd1Q497V5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srbd1Q497V5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Srbd1Q497V5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srbd1Q497V5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srbd1Q497V5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srbd1Q497V5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srbd1Q497V5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srbd1Q497V5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srbd1Q497V5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srbd1Q497V5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Srbd1Q497V5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srbd1Q497V5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms