Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim26Q3V460 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms