Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc110Q3V125 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms