Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933416C03RikQ3V063 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms