Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
BB287469Q3UT53 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BB287469Q3UT53 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms